Az elmúlt években az Open Access terjedésével negatív jelek is megjelentek: áltudományos kiadók ill. folyóiratok (predatory, hijacked), félrevezető mutatószámok (misleading metrics), ragadozó konferenciák keserítik meg a kutatókat, publikálni kívánókat. Az áltudományos lapok és konferenciák, megtévesztő metrikák száma gyorsan nő, fellépésük agresszív és nélkülözik a tudományos minőséget, valamint a szakmai bírálatot. Általában kéretlen elektronikus levelek formájában érkeznek a felhívások, amelyek felkérik a célszemélyt a gyanús folyóiratokba való publikálásra vagy áltudományos konferenciák látogatására.
Hivatalos, nyilvánosan elérhető lista jelenleg nincs az áltudományos, megtévesztő folyóiratokról, konferenciákról, mutatószámokról. Jeffrey Beall amerikai könyvtáros blogja igen részletesen foglalkozott az Open Access-szel kapcsolatos visszaélésekkel; a blog azonban 2017. január 15-én befejezte működését. (Már csak archív változatban olvashatjuk: http://web.archive.org/web/20161230053202/https://scholarlyoa.com/)
A publikálással kapcsolatos veszélyekről részletesebb információt az alábbi almenüpontokban talál:
Félrevezető mutatószámok (Hamis IF)
Ragadozó konferenciák (Predatory conferences)
Folyóiratok tudományos minőségének vizsgálata